Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMDP50402 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMDP50402 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMDP50402 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMDP50402 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMDP50402 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMDP50402 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMDP50402 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMDP50402 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMDP50402 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMDP50402 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMDP50402 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMDP50402 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMDP50402 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMDP50402 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMDP50402 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMDP50402 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
EMDP50402 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EMDP50402 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMDP50402 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMDP50402 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EMDP50402 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMDP50402 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMDP50402 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EMDP50402 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMDP50402 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMDP50402 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EMDP50402 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMDP50402 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMDP50402 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMDP50402 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMDP50402 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMDP50402 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMDP50402 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMDP50402 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EMDP50402 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMDP50402 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMDP50402 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMDP50402 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMDP50402 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMDP50402 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMDP50402 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMDP50402 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMDP50402 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMDP50402 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMDP50402 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMDP50402 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMDP50402 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EMDP50402 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EMDP50402 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMDP50402 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMDP50402 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMDP50402 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMDP50402 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMDP50402 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMDP50402 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMDP50402 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMDP50402 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMDP50402 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMDP50402 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMDP50402 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMDP50402 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMDP50402 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMDP50402 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMDP50402 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMDP50402 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EMDP50402 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMDP50402 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMDP50402 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMDP50402 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMDP50402 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMDP50402 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMDP50402 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMDP50402 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMDP50402 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMDP50402 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMDP50402 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMDP50402 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMDP50402 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMDP50402 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMDP50402 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMDP50402 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMDP50402 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMDP50402 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMDP50402 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMDP50402 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMDP50402 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EMDP50402 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EMDP50402 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMDP50402 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMDP50402 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms