Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
NUP153P49790 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NUP153P49790 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NUP153P49790 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NUP153P49790 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NUP153P49790 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP153P49790 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP153P49790 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP153P49790 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP153P49790 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP153P49790 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP153P49790 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP153P49790 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP153P49790 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP153P49790 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NUP153P49790 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NUP153P49790 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
NUP153P49790 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
NUP153P49790 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NUP153P49790 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NUP153P49790 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NUP153P49790 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NUP153P49790 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NUP153P49790 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NUP153P49790 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NUP153P49790 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NUP153P49790 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NUP153P49790 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NUP153P49790 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NUP153P49790 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
NUP153P49790 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NUP153P49790 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NUP153P49790 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NUP153P49790 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
NUP153P49790 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NUP153P49790 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NUP153P49790 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NUP153P49790 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NUP153P49790 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NUP153P49790 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NUP153P49790 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NUP153P49790 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NUP153P49790 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.26■■■■□ 3.72
NUP153P49790 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
NUP153P49790 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NUP153P49790 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NUP153P49790 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NUP153P49790 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NUP153P49790 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NUP153P49790 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NUP153P49790 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NUP153P49790 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NUP153P49790 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NUP153P49790 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NUP153P49790 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NUP153P49790 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NUP153P49790 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
NUP153P49790 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NUP153P49790 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NUP153P49790 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NUP153P49790 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUP153P49790 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUP153P49790 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUP153P49790 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUP153P49790 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUP153P49790 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NUP153P49790 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUP153P49790 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUP153P49790 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NUP153P49790 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NUP153P49790 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NUP153P49790 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
NUP153P49790 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NUP153P49790 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NUP153P49790 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NUP153P49790 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NUP153P49790 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NUP153P49790 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NUP153P49790 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NUP153P49790 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NUP153P49790 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NUP153P49790 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NUP153P49790 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NUP153P49790 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
NUP153P49790 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NUP153P49790 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NUP153P49790 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NUP153P49790 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
NUP153P49790 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NUP153P49790 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
NUP153P49790 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NUP153P49790 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
NUP153P49790 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NUP153P49790 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NUP153P49790 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NUP153P49790 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
NUP153P49790 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NUP153P49790 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NUP153P49790 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NUP153P49790 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms