Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK1P49759 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK1P49759 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK1P49759 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK1P49759 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK1P49759 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK1P49759 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK1P49759 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK1P49759 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK1P49759 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK1P49759 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK1P49759 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK1P49759 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK1P49759 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK1P49759 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK1P49759 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK1P49759 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK1P49759 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK1P49759 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK1P49759 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK1P49759 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK1P49759 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK1P49759 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK1P49759 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK1P49759 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK1P49759 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK1P49759 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK1P49759 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK1P49759 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK1P49759 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK1P49759 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK1P49759 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK1P49759 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK1P49759 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK1P49759 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK1P49759 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK1P49759 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK1P49759 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK1P49759 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK1P49759 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK1P49759 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK1P49759 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK1P49759 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK1P49759 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK1P49759 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK1P49759 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK1P49759 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK1P49759 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK1P49759 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK1P49759 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK1P49759 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK1P49759 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK1P49759 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK1P49759 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK1P49759 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK1P49759 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK1P49759 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK1P49759 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK1P49759 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK1P49759 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK1P49759 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK1P49759 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK1P49759 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK1P49759 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK1P49759 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK1P49759 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK1P49759 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK1P49759 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK1P49759 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLK1P49759 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLK1P49759 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK1P49759 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK1P49759 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK1P49759 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK1P49759 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK1P49759 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK1P49759 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK1P49759 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK1P49759 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK1P49759 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK1P49759 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLK1P49759 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK1P49759 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK1P49759 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK1P49759 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms