Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POU3F4P49335 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms