Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCTRP47872 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCTRP47872 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCTRP47872 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCTRP47872 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCTRP47872 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCTRP47872 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCTRP47872 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCTRP47872 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCTRP47872 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCTRP47872 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCTRP47872 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCTRP47872 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCTRP47872 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCTRP47872 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCTRP47872 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCTRP47872 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCTRP47872 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCTRP47872 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCTRP47872 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCTRP47872 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCTRP47872 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCTRP47872 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCTRP47872 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCTRP47872 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCTRP47872 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCTRP47872 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCTRP47872 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCTRP47872 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCTRP47872 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCTRP47872 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCTRP47872 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCTRP47872 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCTRP47872 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCTRP47872 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCTRP47872 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCTRP47872 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCTRP47872 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCTRP47872 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCTRP47872 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCTRP47872 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCTRP47872 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCTRP47872 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCTRP47872 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCTRP47872 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCTRP47872 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCTRP47872 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCTRP47872 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCTRP47872 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCTRP47872 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCTRP47872 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCTRP47872 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCTRP47872 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCTRP47872 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCTRP47872 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCTRP47872 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCTRP47872 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCTRP47872 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCTRP47872 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCTRP47872 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCTRP47872 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCTRP47872 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCTRP47872 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCTRP47872 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCTRP47872 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCTRP47872 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCTRP47872 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCTRP47872 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCTRP47872 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCTRP47872 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCTRP47872 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCTRP47872 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCTRP47872 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCTRP47872 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCTRP47872 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCTRP47872 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCTRP47872 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCTRP47872 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCTRP47872 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCTRP47872 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCTRP47872 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCTRP47872 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCTRP47872 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCTRP47872 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCTRP47872 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCTRP47872 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCTRP47872 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCTRP47872 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCTRP47872 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCTRP47872 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCTRP47872 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms