Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSFP46459 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSFP46459 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSFP46459 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSFP46459 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSFP46459 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSFP46459 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSFP46459 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSFP46459 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NSFP46459 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSFP46459 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSFP46459 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSFP46459 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NSFP46459 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSFP46459 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSFP46459 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSFP46459 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSFP46459 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSFP46459 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSFP46459 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSFP46459 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSFP46459 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSFP46459 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSFP46459 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NSFP46459 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NSFP46459 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSFP46459 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSFP46459 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSFP46459 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSFP46459 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSFP46459 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSFP46459 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSFP46459 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSFP46459 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSFP46459 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSFP46459 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSFP46459 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSFP46459 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSFP46459 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSFP46459 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NSFP46459 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NSFP46459 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSFP46459 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSFP46459 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSFP46459 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSFP46459 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSFP46459 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSFP46459 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSFP46459 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSFP46459 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NSFP46459 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSFP46459 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSFP46459 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSFP46459 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSFP46459 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSFP46459 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSFP46459 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSFP46459 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSFP46459 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NSFP46459 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NSFP46459 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSFP46459 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSFP46459 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSFP46459 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSFP46459 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSFP46459 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSFP46459 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSFP46459 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSFP46459 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSFP46459 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSFP46459 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSFP46459 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSFP46459 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSFP46459 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSFP46459 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NSFP46459 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSFP46459 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSFP46459 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSFP46459 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSFP46459 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSFP46459 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSFP46459 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSFP46459 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSFP46459 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSFP46459 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSFP46459 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSFP46459 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSFP46459 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms