Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A2P43004 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A2P43004 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A2P43004 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms