Protein–RNA interactions for Protein: P42785

PRCP, Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCPP42785 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRCPP42785 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRCPP42785 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRCPP42785 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRCPP42785 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRCPP42785 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRCPP42785 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRCPP42785 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRCPP42785 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRCPP42785 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRCPP42785 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRCPP42785 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRCPP42785 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRCPP42785 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRCPP42785 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRCPP42785 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRCPP42785 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRCPP42785 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRCPP42785 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRCPP42785 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRCPP42785 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRCPP42785 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRCPP42785 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRCPP42785 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRCPP42785 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRCPP42785 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRCPP42785 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRCPP42785 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRCPP42785 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRCPP42785 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRCPP42785 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRCPP42785 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRCPP42785 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRCPP42785 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRCPP42785 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRCPP42785 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRCPP42785 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRCPP42785 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRCPP42785 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRCPP42785 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRCPP42785 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRCPP42785 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRCPP42785 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRCPP42785 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRCPP42785 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRCPP42785 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRCPP42785 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRCPP42785 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRCPP42785 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRCPP42785 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRCPP42785 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRCPP42785 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRCPP42785 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRCPP42785 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRCPP42785 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRCPP42785 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRCPP42785 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRCPP42785 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRCPP42785 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRCPP42785 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRCPP42785 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRCPP42785 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRCPP42785 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRCPP42785 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRCPP42785 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRCPP42785 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRCPP42785 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRCPP42785 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRCPP42785 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRCPP42785 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRCPP42785 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRCPP42785 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRCPP42785 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRCPP42785 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRCPP42785 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRCPP42785 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRCPP42785 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRCPP42785 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRCPP42785 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRCPP42785 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRCPP42785 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRCPP42785 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRCPP42785 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRCPP42785 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRCPP42785 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRCPP42785 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRCPP42785 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms