Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA2P42765 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACAA2P42765 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms