Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRPPRCP42704 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRPPRCP42704 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRPPRCP42704 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
LRPPRCP42704 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRPPRCP42704 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms