Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC1P41238 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms