Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ZEB1P37275 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZEB1P37275 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZEB1P37275 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ZEB1P37275 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ZEB1P37275 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
ZEB1P37275 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ZEB1P37275 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms