Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms