Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP6V1E1P36543 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP6V1E1P36543 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms