Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
THBS4P35443 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS4P35443 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS4P35443 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS4P35443 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS4P35443 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS4P35443 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS4P35443 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS4P35443 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS4P35443 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS4P35443 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
THBS4P35443 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
THBS4P35443 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
THBS4P35443 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
THBS4P35443 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
THBS4P35443 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
THBS4P35443 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
THBS4P35443 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
THBS4P35443 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THBS4P35443 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THBS4P35443 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
THBS4P35443 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THBS4P35443 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
THBS4P35443 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THBS4P35443 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THBS4P35443 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THBS4P35443 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
THBS4P35443 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
THBS4P35443 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
THBS4P35443 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
THBS4P35443 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
THBS4P35443 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
THBS4P35443 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
THBS4P35443 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
THBS4P35443 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
THBS4P35443 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
THBS4P35443 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
THBS4P35443 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
THBS4P35443 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THBS4P35443 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
THBS4P35443 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
THBS4P35443 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THBS4P35443 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
THBS4P35443 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
THBS4P35443 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THBS4P35443 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
THBS4P35443 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
THBS4P35443 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
THBS4P35443 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THBS4P35443 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
THBS4P35443 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THBS4P35443 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
THBS4P35443 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THBS4P35443 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
THBS4P35443 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
THBS4P35443 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
THBS4P35443 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THBS4P35443 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THBS4P35443 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
THBS4P35443 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THBS4P35443 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
THBS4P35443 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
THBS4P35443 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
THBS4P35443 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THBS4P35443 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
THBS4P35443 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms