Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL9P32969 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL9P32969 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL9P32969 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL9P32969 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL9P32969 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL9P32969 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL9P32969 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL9P32969 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL9P32969 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL9P32969 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL9P32969 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL9P32969 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL9P32969 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL9P32969 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL9P32969 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL9P32969 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL9P32969 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL9P32969 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL9P32969 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL9P32969 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL9P32969 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL9P32969 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL9P32969 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL9P32969 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL9P32969 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL9P32969 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL9P32969 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL9P32969 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL9P32969 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL9P32969 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL9P32969 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL9P32969 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL9P32969 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL9P32969 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL9P32969 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL9P32969 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL9P32969 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL9P32969 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL9P32969 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPL9P32969 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPL9P32969 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL9P32969 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL9P32969 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL9P32969 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL9P32969 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL9P32969 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL9P32969 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL9P32969 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL9P32969 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL9P32969 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL9P32969 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL9P32969 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL9P32969 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL9P32969 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL9P32969 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL9P32969 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL9P32969 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL9P32969 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL9P32969 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL9P32969 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL9P32969 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL9P32969 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL9P32969 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL9P32969 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL9P32969 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL9P32969 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL9P32969 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL9P32969 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL9P32969 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL9P32969 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL9P32969 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL9P32969 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL9P32969 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL9P32969 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL9P32969 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL9P32969 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL9P32969 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL9P32969 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL9P32969 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPL9P32969 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL9P32969 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL9P32969 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL9P32969 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL9P32969 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL9P32969 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL9P32969 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL9P32969 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL9P32969 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL9P32969 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL9P32969 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL9P32969 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL9P32969 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL9P32969 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL9P32969 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL9P32969 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL9P32969 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL9P32969 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL9P32969 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL9P32969 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms