Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CXCR5P32302 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR5P32302 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR5P32302 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms