Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRA5P31644 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA5P31644 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA5P31644 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA5P31644 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA5P31644 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA5P31644 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA5P31644 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA5P31644 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA5P31644 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA5P31644 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA5P31644 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA5P31644 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA5P31644 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA5P31644 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA5P31644 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA5P31644 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms