Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CDC27P30260 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC27P30260 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC27P30260 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC27P30260 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC27P30260 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC27P30260 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC27P30260 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC27P30260 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC27P30260 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC27P30260 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC27P30260 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC27P30260 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC27P30260 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC27P30260 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC27P30260 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC27P30260 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC27P30260 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC27P30260 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC27P30260 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC27P30260 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC27P30260 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC27P30260 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC27P30260 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC27P30260 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC27P30260 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC27P30260 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC27P30260 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC27P30260 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC27P30260 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC27P30260 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC27P30260 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC27P30260 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC27P30260 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC27P30260 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC27P30260 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC27P30260 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC27P30260 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC27P30260 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC27P30260 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC27P30260 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC27P30260 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC27P30260 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC27P30260 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC27P30260 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC27P30260 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC27P30260 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC27P30260 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC27P30260 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC27P30260 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC27P30260 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC27P30260 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC27P30260 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC27P30260 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC27P30260 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC27P30260 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC27P30260 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC27P30260 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC27P30260 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC27P30260 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDC27P30260 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC27P30260 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC27P30260 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC27P30260 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC27P30260 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC27P30260 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC27P30260 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC27P30260 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC27P30260 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC27P30260 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC27P30260 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC27P30260 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC27P30260 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC27P30260 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC27P30260 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC27P30260 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC27P30260 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC27P30260 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC27P30260 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC27P30260 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC27P30260 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC27P30260 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC27P30260 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC27P30260 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC27P30260 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC27P30260 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC27P30260 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC27P30260 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC27P30260 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC27P30260 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC27P30260 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC27P30260 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC27P30260 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC27P30260 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC27P30260 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC27P30260 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC27P30260 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC27P30260 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC27P30260 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC27P30260 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms