Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK1P30085 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK1P30085 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms