Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB2P29323 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB2P29323 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB2P29323 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms