Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VARSP26640 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VARSP26640 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VARSP26640 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VARSP26640 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VARSP26640 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VARSP26640 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VARSP26640 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VARSP26640 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VARSP26640 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VARSP26640 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VARSP26640 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VARSP26640 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VARSP26640 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VARSP26640 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VARSP26640 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VARSP26640 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VARSP26640 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VARSP26640 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VARSP26640 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VARSP26640 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VARSP26640 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VARSP26640 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VARSP26640 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VARSP26640 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VARSP26640 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VARSP26640 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VARSP26640 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VARSP26640 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VARSP26640 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VARSP26640 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VARSP26640 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VARSP26640 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VARSP26640 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VARSP26640 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VARSP26640 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VARSP26640 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VARSP26640 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VARSP26640 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VARSP26640 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VARSP26640 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VARSP26640 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VARSP26640 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VARSP26640 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VARSP26640 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VARSP26640 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VARSP26640 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VARSP26640 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VARSP26640 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VARSP26640 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VARSP26640 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VARSP26640 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VARSP26640 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VARSP26640 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VARSP26640 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VARSP26640 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VARSP26640 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VARSP26640 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VARSP26640 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VARSP26640 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VARSP26640 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VARSP26640 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VARSP26640 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VARSP26640 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VARSP26640 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms