Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA2P25787 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA2P25787 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA2P25787 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA2P25787 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA2P25787 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA2P25787 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMA2P25787 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMA2P25787 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMA2P25787 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMA2P25787 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMA2P25787 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMA2P25787 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms