Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTAFRP25105 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTAFRP25105 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTAFRP25105 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms