Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP24386 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP24386 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP24386 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP24386 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP24386 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP24386 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP24386 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP24386 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP24386 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP24386 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP24386 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP24386 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP24386 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP24386 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP24386 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP24386 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP24386 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP24386 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP24386 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP24386 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP24386 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP24386 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP24386 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP24386 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP24386 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP24386 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP24386 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP24386 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP24386 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP24386 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP24386 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP24386 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP24386 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP24386 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP24386 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP24386 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP24386 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP24386 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP24386 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP24386 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP24386 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP24386 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP24386 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP24386 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP24386 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP24386 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP24386 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP24386 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP24386 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP24386 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP24386 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP24386 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP24386 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP24386 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP24386 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP24386 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP24386 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP24386 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP24386 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP24386 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP24386 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP24386 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP24386 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP24386 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP24386 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP24386 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP24386 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP24386 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP24386 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP24386 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP24386 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP24386 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP24386 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP24386 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP24386 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP24386 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP24386 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP24386 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP24386 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP24386 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP24386 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP24386 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP24386 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP24386 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP24386 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP24386 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP24386 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP24386 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP24386 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms