Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFYAP23511 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFYAP23511 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFYAP23511 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFYAP23511 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NFYAP23511 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFYAP23511 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFYAP23511 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFYAP23511 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFYAP23511 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFYAP23511 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFYAP23511 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFYAP23511 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFYAP23511 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFYAP23511 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFYAP23511 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFYAP23511 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFYAP23511 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFYAP23511 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFYAP23511 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFYAP23511 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFYAP23511 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFYAP23511 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFYAP23511 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFYAP23511 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFYAP23511 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFYAP23511 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFYAP23511 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFYAP23511 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFYAP23511 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFYAP23511 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFYAP23511 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFYAP23511 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFYAP23511 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFYAP23511 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFYAP23511 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFYAP23511 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFYAP23511 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFYAP23511 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFYAP23511 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NFYAP23511 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFYAP23511 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFYAP23511 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFYAP23511 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFYAP23511 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFYAP23511 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFYAP23511 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFYAP23511 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFYAP23511 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NFYAP23511 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFYAP23511 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFYAP23511 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFYAP23511 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFYAP23511 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFYAP23511 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFYAP23511 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFYAP23511 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFYAP23511 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFYAP23511 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFYAP23511 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFYAP23511 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFYAP23511 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFYAP23511 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFYAP23511 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFYAP23511 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFYAP23511 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFYAP23511 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFYAP23511 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFYAP23511 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFYAP23511 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFYAP23511 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFYAP23511 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFYAP23511 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFYAP23511 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFYAP23511 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFYAP23511 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFYAP23511 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFYAP23511 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFYAP23511 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFYAP23511 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms