Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.153e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.153e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 PPIH-204ENST00000436387 416 ntTSL 37.67□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SF3B1-209ENST00000479532 587 ntTSL 26.03□□□□□ -1.444e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 S100P-202ENST00000513778 313 ntTSL 34.93□□□□□ -1.629e-8■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-215ENST00000566336 686 ntTSL 53.95□□□□□ -1.784e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 KDM5B-209ENST00000498276 560 ntTSL 40.3□□□□□ -2.364e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-211ENST00000563253 566 ntTSL 3-0.16□□□□□ -2.444e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CLTC-208ENST00000496076 678 ntTSL 21.36□□□□□ -2.191e-8■■■■■ 40.5
RPS3P23396 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 POLR2G-204ENST00000526368 710 ntTSL 26.15□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 40.5
RPS3P23396 PCCB-219ENST00000494742 547 ntTSL 413.93□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 40.5
RPS3P23396 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.236e-9■■■■■ 40.5
RPS3P23396 MRPL2-206ENST00000485654 428 ntTSL 212.54□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.688e-8■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.112e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.14e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.992e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CTU2-207ENST00000565071 894 ntTSL 221.21■□□□□ 0.994e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NAA20-207ENST00000484480 1222 ntTSL 520.66■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.873e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PPP5C-213ENST00000527623 1215 ntTSL 220.4■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.854e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.853e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.754e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR18-210ENST00000591997 577 ntTSL 319.33■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 40.4
RPS3P23396 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.663e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 SNAP23-213ENST00000566327 568 ntTSL 419.17■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR6-213ENST00000473238 568 ntTSL 319.06■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CTU2-204ENST00000564105 1586 ntTSL 1 (best)18.93■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PPP5C-211ENST00000525507 1300 ntTSL 218.92■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.581e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR18-209ENST00000591985 1498 ntTSL 518.39■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 40.4
RPS3P23396 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 40.4
RPS3P23396 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.383e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GMNN-203ENST00000378054 653 ntTSL 317.22■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 517.18■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-205ENST00000460901 774 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.335e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.315e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PPP5C-206ENST00000486994 2209 ntTSL 216.78■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSPH-207ENST00000421626 826 ntTSL 416.75■□□□□ 0.272e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-212ENST00000575400 858 ntTSL 316.58■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MYO5A-210ENST00000556196 3008 ntTSL 216.48■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR18-211ENST00000607440 1397 ntTSL 516.16■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSMD4-212ENST00000491857 461 ntTSL 216.06■□□□□ 0.168e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 515.93■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSPH-209ENST00000427797 809 ntTSL 315.93■□□□□ 0.142e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR6-210ENST00000462064 589 ntTSL 515.87■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.135e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.11e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 TXNL1-206ENST00000587807 2035 ntTSL 215.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 ALDH2-203ENST00000548536 1760 ntTSL 315.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR18-201ENST00000251289 1501 ntTSL 515.38■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GYPC-205ENST00000464053 1805 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR18-208ENST00000591276 607 ntTSL 315.14■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -03e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 WDR18-205ENST00000590354 678 ntTSL 214.87□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.065e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PPP5C-207ENST00000487483 4675 ntTSL 514.66□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PPP5C-205ENST00000478046 1886 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PRKN-207ENST00000479615 904 ntTSL 514.57□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 ALDH2-204ENST00000549106 580 ntTSL 314.55□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSPH-206ENST00000421312 633 ntTSL 514.51□□□□□ -0.092e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.121e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NBR1-207ENST00000592304 964 ntTSL 214.31□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.138e-8■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.153e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 RNF167-203ENST00000570492 766 ntTSL 313.73□□□□□ -0.211e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 PSPH-205ENST00000419984 744 ntTSL 313.7□□□□□ -0.222e-11■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.238e-8■■■■■ 40.4
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