Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FGFR3P22607 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGFR3P22607 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGFR3P22607 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms