Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH3P22223 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH3P22223 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH3P22223 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH3P22223 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH3P22223 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH3P22223 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH3P22223 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH3P22223 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH3P22223 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH3P22223 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH3P22223 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH3P22223 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH3P22223 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH3P22223 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH3P22223 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH3P22223 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH3P22223 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH3P22223 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH3P22223 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH3P22223 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH3P22223 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH3P22223 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH3P22223 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH3P22223 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH3P22223 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH3P22223 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH3P22223 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH3P22223 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH3P22223 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH3P22223 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH3P22223 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH3P22223 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH3P22223 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH3P22223 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH3P22223 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH3P22223 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH3P22223 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH3P22223 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH3P22223 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH3P22223 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH3P22223 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH3P22223 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH3P22223 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH3P22223 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH3P22223 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH3P22223 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH3P22223 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH3P22223 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH3P22223 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH3P22223 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH3P22223 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH3P22223 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH3P22223 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH3P22223 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH3P22223 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH3P22223 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH3P22223 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH3P22223 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH3P22223 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH3P22223 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH3P22223 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH3P22223 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH3P22223 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH3P22223 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH3P22223 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH3P22223 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH3P22223 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH3P22223 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH3P22223 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH3P22223 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH3P22223 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH3P22223 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH3P22223 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH3P22223 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH3P22223 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH3P22223 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH3P22223 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH3P22223 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms