Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTNP21246 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTNP21246 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTNP21246 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTNP21246 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTNP21246 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTNP21246 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTNP21246 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTNP21246 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTNP21246 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTNP21246 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTNP21246 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTNP21246 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTNP21246 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTNP21246 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTNP21246 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTNP21246 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTNP21246 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTNP21246 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTNP21246 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTNP21246 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTNP21246 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTNP21246 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTNP21246 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTNP21246 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTNP21246 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTNP21246 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTNP21246 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTNP21246 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTNP21246 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTNP21246 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTNP21246 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTNP21246 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTNP21246 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTNP21246 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTNP21246 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTNP21246 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTNP21246 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTNP21246 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTNP21246 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTNP21246 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTNP21246 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTNP21246 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTNP21246 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTNP21246 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTNP21246 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTNP21246 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTNP21246 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTNP21246 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTNP21246 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTNP21246 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTNP21246 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTNP21246 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTNP21246 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTNP21246 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTNP21246 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTNP21246 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTNP21246 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTNP21246 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTNP21246 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTNP21246 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTNP21246 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTNP21246 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTNP21246 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTNP21246 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTNP21246 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTNP21246 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTNP21246 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTNP21246 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTNP21246 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTNP21246 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTNP21246 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTNP21246 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTNP21246 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTNP21246 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTNP21246 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTNP21246 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTNP21246 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTNP21246 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTNP21246 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTNP21246 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTNP21246 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTNP21246 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTNP21246 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTNP21246 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTNP21246 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTNP21246 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms