Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK11BP21127 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK11BP21127 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms