Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN3P20807 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN3P20807 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms