Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR1D1P20393 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms