Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB4AP20338 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms