Protein–RNA interactions for Protein: P20231

TPSB2, Tryptase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPSB2P20231 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPSB2P20231 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPSB2P20231 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms