Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFRAP16234 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDGFRAP16234 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDGFRAP16234 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms