Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD44P16070 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD44P16070 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD44P16070 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD44P16070 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD44P16070 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD44P16070 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD44P16070 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD44P16070 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD44P16070 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD44P16070 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD44P16070 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD44P16070 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD44P16070 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD44P16070 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD44P16070 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD44P16070 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD44P16070 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD44P16070 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD44P16070 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD44P16070 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD44P16070 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD44P16070 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD44P16070 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD44P16070 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD44P16070 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD44P16070 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CD44P16070 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD44P16070 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD44P16070 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD44P16070 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD44P16070 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD44P16070 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD44P16070 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD44P16070 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD44P16070 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD44P16070 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD44P16070 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD44P16070 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CD44P16070 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CD44P16070 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD44P16070 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD44P16070 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD44P16070 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD44P16070 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD44P16070 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD44P16070 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD44P16070 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CD44P16070 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD44P16070 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD44P16070 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD44P16070 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD44P16070 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CD44P16070 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD44P16070 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD44P16070 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD44P16070 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD44P16070 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD44P16070 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD44P16070 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD44P16070 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD44P16070 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD44P16070 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD44P16070 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CD44P16070 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CD44P16070 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD44P16070 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD44P16070 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CD44P16070 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD44P16070 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD44P16070 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD44P16070 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD44P16070 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD44P16070 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD44P16070 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD44P16070 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD44P16070 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD44P16070 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD44P16070 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD44P16070 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD44P16070 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD44P16070 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD44P16070 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD44P16070 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD44P16070 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD44P16070 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD44P16070 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CD44P16070 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms