Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MYOD1P15172 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MYOD1P15172 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYOD1P15172 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms