Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CFTRP13569 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CFTRP13569 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CFTRP13569 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CFTRP13569 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CFTRP13569 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CFTRP13569 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
CFTRP13569 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
CFTRP13569 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CFTRP13569 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CFTRP13569 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
CFTRP13569 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CFTRP13569 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CFTRP13569 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CFTRP13569 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CFTRP13569 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CFTRP13569 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CFTRP13569 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CFTRP13569 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CFTRP13569 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CFTRP13569 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CFTRP13569 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CFTRP13569 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
CFTRP13569 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CFTRP13569 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CFTRP13569 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CFTRP13569 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CFTRP13569 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
CFTRP13569 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CFTRP13569 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CFTRP13569 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CFTRP13569 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CFTRP13569 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CFTRP13569 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CFTRP13569 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CFTRP13569 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CFTRP13569 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CFTRP13569 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CFTRP13569 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CFTRP13569 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CFTRP13569 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CFTRP13569 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CFTRP13569 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CFTRP13569 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CFTRP13569 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CFTRP13569 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CFTRP13569 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CFTRP13569 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CFTRP13569 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CFTRP13569 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CFTRP13569 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CFTRP13569 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CFTRP13569 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
CFTRP13569 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CFTRP13569 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CFTRP13569 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
CFTRP13569 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CFTRP13569 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CFTRP13569 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CFTRP13569 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CFTRP13569 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CFTRP13569 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
CFTRP13569 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CFTRP13569 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CFTRP13569 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CFTRP13569 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CFTRP13569 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CFTRP13569 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CFTRP13569 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CFTRP13569 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CFTRP13569 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFTRP13569 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CFTRP13569 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CFTRP13569 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CFTRP13569 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CFTRP13569 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CFTRP13569 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
CFTRP13569 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
CFTRP13569 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CFTRP13569 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CFTRP13569 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CFTRP13569 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
CFTRP13569 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CFTRP13569 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CFTRP13569 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
CFTRP13569 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CFTRP13569 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CFTRP13569 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CFTRP13569 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CFTRP13569 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms