Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRFP11831 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRFP11831 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRFP11831 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRFP11831 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRFP11831 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRFP11831 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRFP11831 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRFP11831 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRFP11831 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRFP11831 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRFP11831 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFP11831 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFP11831 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFP11831 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFP11831 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFP11831 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFP11831 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRFP11831 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRFP11831 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRFP11831 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRFP11831 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRFP11831 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRFP11831 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRFP11831 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRFP11831 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRFP11831 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRFP11831 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRFP11831 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRFP11831 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFP11831 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFP11831 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFP11831 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFP11831 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFP11831 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFP11831 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFP11831 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRFP11831 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRFP11831 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRFP11831 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRFP11831 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRFP11831 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRFP11831 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRFP11831 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRFP11831 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRFP11831 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFP11831 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFP11831 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFP11831 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFP11831 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFP11831 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFP11831 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFP11831 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFP11831 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFP11831 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFP11831 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFP11831 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRFP11831 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRFP11831 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRFP11831 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRFP11831 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRFP11831 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRFP11831 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRFP11831 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRFP11831 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRFP11831 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRFP11831 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRFP11831 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRFP11831 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRFP11831 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRFP11831 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRFP11831 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRFP11831 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRFP11831 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFP11831 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFP11831 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFP11831 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFP11831 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFP11831 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFP11831 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFP11831 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFP11831 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFP11831 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFP11831 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFP11831 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFP11831 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFP11831 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFP11831 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFP11831 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFP11831 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFP11831 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRFP11831 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRFP11831 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRFP11831 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRFP11831 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRFP11831 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRFP11831 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRFP11831 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRFP11831 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRFP11831 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms