Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP2C9P11712 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CYP2C9P11712 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYP2C9P11712 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms