Protein–RNA interactions for Protein: P11172

UMPS, Uridine 5'-monophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMPSP11172 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UMPSP11172 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UMPSP11172 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UMPSP11172 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UMPSP11172 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UMPSP11172 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UMPSP11172 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UMPSP11172 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UMPSP11172 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UMPSP11172 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UMPSP11172 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UMPSP11172 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UMPSP11172 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UMPSP11172 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UMPSP11172 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UMPSP11172 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UMPSP11172 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UMPSP11172 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UMPSP11172 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UMPSP11172 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UMPSP11172 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UMPSP11172 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UMPSP11172 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UMPSP11172 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UMPSP11172 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UMPSP11172 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UMPSP11172 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UMPSP11172 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UMPSP11172 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UMPSP11172 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UMPSP11172 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UMPSP11172 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UMPSP11172 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UMPSP11172 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UMPSP11172 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UMPSP11172 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UMPSP11172 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UMPSP11172 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UMPSP11172 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UMPSP11172 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UMPSP11172 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UMPSP11172 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UMPSP11172 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UMPSP11172 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UMPSP11172 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UMPSP11172 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UMPSP11172 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UMPSP11172 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UMPSP11172 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UMPSP11172 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UMPSP11172 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UMPSP11172 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UMPSP11172 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UMPSP11172 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UMPSP11172 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UMPSP11172 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UMPSP11172 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UMPSP11172 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UMPSP11172 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UMPSP11172 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UMPSP11172 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UMPSP11172 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UMPSP11172 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UMPSP11172 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UMPSP11172 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UMPSP11172 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UMPSP11172 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UMPSP11172 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UMPSP11172 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UMPSP11172 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UMPSP11172 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UMPSP11172 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UMPSP11172 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UMPSP11172 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UMPSP11172 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UMPSP11172 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms