Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VSIG10L2P0DP72 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VSIG10L2P0DP72 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms