Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRGAP2BP0DMP2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP2BP0DMP2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRGAP2BP0DMP2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms