Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf88P0DMB2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms