Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPA8P0DM63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA8P0DM63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA8P0DM63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms