Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF728P0DKX0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF728P0DKX0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF728P0DKX0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms