Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM58BPP0C7Q3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM58BPP0C7Q3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM58BPP0C7Q3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM58BPP0C7Q3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms