Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40ALP0C0E4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB40ALP0C0E4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40ALP0C0E4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms