Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP1P09455 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP1P09455 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP1P09455 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP1P09455 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP1P09455 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP1P09455 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP1P09455 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP1P09455 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP1P09455 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP1P09455 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP1P09455 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP1P09455 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP1P09455 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP1P09455 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP1P09455 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP1P09455 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP1P09455 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP1P09455 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP1P09455 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP1P09455 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP1P09455 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP1P09455 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP1P09455 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP1P09455 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RBP1P09455 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBP1P09455 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBP1P09455 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP1P09455 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP1P09455 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP1P09455 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP1P09455 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP1P09455 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP1P09455 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP1P09455 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP1P09455 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP1P09455 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP1P09455 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP1P09455 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP1P09455 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP1P09455 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP1P09455 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP1P09455 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP1P09455 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP1P09455 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP1P09455 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP1P09455 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP1P09455 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP1P09455 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP1P09455 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP1P09455 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP1P09455 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP1P09455 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBP1P09455 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP1P09455 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP1P09455 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP1P09455 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP1P09455 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP1P09455 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP1P09455 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP1P09455 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP1P09455 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP1P09455 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP1P09455 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP1P09455 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP1P09455 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP1P09455 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP1P09455 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP1P09455 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP1P09455 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP1P09455 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP1P09455 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP1P09455 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP1P09455 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP1P09455 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP1P09455 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP1P09455 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP1P09455 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP1P09455 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP1P09455 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP1P09455 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms